2020年10月30号，中国医学科学院系统医学研究中心苏州系统医学研究所吴爱平课题组在Briefings in Bioinformatics发表了“Compositional diversity and evolutionary pattern of coronavirus accessory proteins”论文。该研究开发了一个半自动的冠状病毒基因组组成注释工具CoroAnnoter，系统解析了所有冠状病毒附属蛋白的多样性组成和进化模式。
新冠病毒（SARS-CoV-2）是继SARS病毒（SARS-CoV）和MERS病毒（MERS-CoV）后第三种导致人类严重疾病的冠状病毒。如此多样的致病性冠状病毒的出现，也提醒人们有必要去系统探索冠状病毒群体的基因多样性组成，特别是毒株间差异显著的附属蛋白的组成图谱和分子进化关系。本研究开发了一个半自动的冠状病毒注释工具CoroAnnoter，并应用于39种冠状病毒代表株的基因组结构注释。研究表明，不同类型冠状病毒毒株的附属蛋白个数差别巨大，介于1-10个之间，其中SARS-CoV-2和SARS-CoV具有最多的附属蛋白，分别为9个和10个。附属蛋白在冠状病毒的四个属（α、β、γ和δ）中具有显著的属内保守性和属间多样性。本研究不仅提供了一个冠状病毒基因组标准化注释工具，还为冠状病毒附属蛋白的组成和进化研究提供了一个综合参考图谱，为冠状病毒的功能多样性研究提供了有效支持。
图：冠状病毒附属蛋白组成图谱
本研究工作得到中国医学科学院医学与健康科技创新工程(2016-I2M-1-005)，国家重点研发计划(2016YFD0500301)，国家自然科学基金(31900472)等项目的资助。苏州系统医学研究所吴爱平研究员为论文通讯作者，商敬哲博士为论文的第一作者。
论文链接：https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbaa262/5943788
文字|系统所
